Histopathology data for Mipep

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #2 Tibia [MA:0001361]
HET M #4 Skin [MA:0000151]
HET F #1 Heart [MA:0000072]
HET F #1 Stomach [MA:0000353]
HET F #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #4 Small intestine [MA:0000337]
HET M #4 Brain [MA:0000168]
HET F #1 Esophagus [MA:0000352]
HET F #3 Tooth [MA:0000348]
HET M #4 Femur [MA:0001359]
HET F #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #3 Liver [MA:0000358]
HET F #3 Pancreas [MA:0000120]
HET M #4 Tooth [MA:0000348]
HET F #3 Skin [MA:0000151]
HET F #1 Pancreas [MA:0000120]
HET M #2 Femur [MA:0001359]
HET F #3 Brain [MA:0000168]
HET M #4 Pancreas [MA:0000120]
HET M #4 Liver [MA:0000358]
HET M #2 Tooth [MA:0000348]
HET F #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #2 Ear [MA:0000236]
HET F #3 Esophagus [MA:0000352]
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #2 Thymus [MA:0000142]
HET F #3 Tibia [MA:0001361]
HET F #1 Liver [MA:0000358]
HET F #3 Small intestine [MA:0000337]
HET M #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #2 Skin [MA:0000151]
HET F #3 Uterus [MA:0000389]
HET F #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #4 Esophagus [MA:0000352]
HET F #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #2 Pancreas [MA:0000120]
HET M #4 Tibia [MA:0001361]
HET M #4 Ear [MA:0000236]
HET M #2 Liver [MA:0000358]
HET F #1 Femur [MA:0001359]
HET F #3 Heart [MA:0000072]
HET M #2 Brain [MA:0000168]
HET M #2 Small intestine [MA:0000337]
HET F #3 Femur [MA:0001359]
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #1 Large intestine [MA:0000333]
HET F #3 Thymus [MA:0000142]
HET M #2 Esophagus [MA:0000352]
HET M #4 Stomach [MA:0000353]
HET F #3 Ear [MA:0000236]
HET F #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #2 Lymph node [MA:0000139]
HET M #2 Trachea [MA:0000441]
HET M #4 Epididymis [MA:0000397]
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #1 Eye [MA:0000261]
HET F #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #3 Bone [MA:0001459]
HET M #2 Heart [MA:0000072]
HET F #1 Tooth [MA:0000348]
HET F #3 Ovary [MA:0000384]
HET M #2 Sternum [MA:0001331]
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #3 Trachea [MA:0000441]
HET M #2 Thyroid
HET M #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #2 Knee joint [MA:0000471]
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #3 Kidney [MA:0000368]
HET M #2 Kidney [MA:0000368]
HET M #2 Bone [MA:0001459]
HET F #3 Lymph node [MA:0000139]
HET F #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #4 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #3 Tongue [MA:0000347]
HET M #2 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #3 Lung [MA:0000415]
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #3 Knee joint [MA:0000471]
HET M #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #2 Large intestine [MA:0000333]
HET M #4 Testis [MA:0000411]
HET M #2 Eye [MA:0000261]
HET M #2 Tongue [MA:0000347]
HET M #4 Tongue [MA:0000347]
HET M #4 Thyroid
HET M #4 Lung [MA:0000415]
HET F #1 Ovary [MA:0000384]
HET F #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #4 Eye [MA:0000261]
HET F #3 Thyroid
HET M #2 Lung [MA:0000415]
HET F #1 Thymus [MA:0000142]
HET F #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #4 Spleen [MA:0000141]
HET F #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #3 Large intestine [MA:0000333]
HET F #3 Sternum [MA:0001331]
HET M #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #4 Sternum [MA:0001331]
HET M #2 Testis [MA:0000411]
HET F #1 Sternum [MA:0001331]
HET M #2 Spleen [MA:0000141]
HET M #4 Large intestine [MA:0000333]
HET F #3 Spleen [MA:0000141]
HET F #1 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #1 Tibia [MA:0001361]
HET F #1 Spleen [MA:0000141]
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #1 Ear [MA:0000236]
HET M #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #1 Lung [MA:0000415]
HET M #4 Knee joint [MA:0000471]
HET F #1 Uterus [MA:0000389]
HET F #1 Tongue [MA:0000347]
HET F #1 Brain [MA:0000168]
HET M #4 Heart [MA:0000072]
HET F #1 Small intestine [MA:0000337]
HET M #2 Stomach [MA:0000353]
HET F #3 Eye [MA:0000261]
HET F #1 Thyroid
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #1 Skin [MA:0000151]
HET M #2 Epididymis [MA:0000397]
HET M #4 Thymus [MA:0000142]
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #4 Kidney [MA:0000368]
HET F #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #4 Bone [MA:0001459]
HET F #1 Bone [MA:0001459]
HET M #2 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #4 Trachea [MA:0000441]
HET M #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #3 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #4 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #4 Lymph node [MA:0000139]
HET F #1 Trachea [MA:0000441]
HET F #3 Stomach [MA:0000353]
HET F #1 Knee joint [MA:0000471]
HET F #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #1 Lymph node [MA:0000139]
HET F #1 Kidney [MA:0000368]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter