Histopathology data for Atp6v1c1

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #4 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #4 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #3 Testis [MA:0000411] 0 0
HET F #2 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET M #4 Thyroid 0 0
HET F #1 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #3 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #3 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #4 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #4 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #4 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #3 Thyroid 0 0
HET F #2 Thyroid 0 0
HET M #4 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #1 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #1 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET F #1 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET M #3 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #4 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #1 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET M #3 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET M #3 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #2 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #2 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #4 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #3 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #2 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #4 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #1 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #1 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #1 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET F #1 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #3 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #3 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #1 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #1 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #1 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET M #4 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #4 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #2 Lymph node [MA:0000139] 3 0 chronic distributed Lymphoma.
HET M #4 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #4 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #1 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET M #3 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #1 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #2 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #4 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET M #3 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #1 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #2 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #2 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #4 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #4 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #4 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #3 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET M #4 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #2 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #4 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #1 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #1 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #4 Testis [MA:0000411] 0 0
HET M #3 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #1 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #2 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #3 Heart [MA:0000072] 2 0 localized chronic Right ventricular epicardial fibrosis, focal
HET F #1 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #3 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #2 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #2 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #3 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #1 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #4 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #3 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #2 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #1 Thyroid 0 0
HET F #1 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #1 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET M #3 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET F #2 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET M #3 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET F #2 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET F #1 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #2 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET M #3 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET F #1 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #2 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #3 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #1 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #2 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET F #2 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #3 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #3 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #2 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #3 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #2 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET M #3 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET F #1 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #3 Sternum [MA:0001331] 3 0 localized chronic Sternal segment dislocation
HET F #1 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #1 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #2 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #4 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #1 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #4 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #3 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #4 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET M #4 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #2 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #4 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET M #4 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #3 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #1 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #3 Brain [MA:0000168] 2 0 chronic bilateral hydrocephalus, lateral ventricle
HET M #3 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #4 Heart [MA:0000072] 2 0 localized chronic Right ventricular epicardial fibrosis, focal
HET F #1 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #4 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET M #4 Sternum [MA:0001331] 3 0 chronic localized Sternal segment dislocation
HET M #3 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #2 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #1 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #1 Stomach [MA:0000353] 1 0 localized subacute Gastritis, subacute.
HET M #3 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #4 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #1 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #1 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #2 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #2 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #4 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #3 Kidney [MA:0000368] 0 0

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter